Szkodliwe działanie mikroorganizmów
Szkodliwe działanie mikroorganizmów ujawnia się także w wielu dziedzinach gospodarki człowieka i w przyrodzie, przede wszystkim jednak spełniają one pożyteczną rolę. Już od dawna stosuje się je w gospodarstwie domowym i w przemyśle, gdzie są nie do zastąpienia. Ich zastosowania rozciągają się od przetwórstwa podstawowych produktów rolniczych do katalizy skomplikowanych reakcji chemicznych.
Klasyczne procesy mikrobiologiczne. Wykorzystywanie od najdawniejszych czasów drożdży do produkcji wina i piwa oraz wypieku chleba, bakterii mlekowych w przetwórstwie mlecznym oraz bakterii kwasu octowego do wytwarzania octu świadczy o tym, że mikroorganizmy są najdawniej udomowionymi organizmami. W Japonii i Indonezji ziarna soi są preparowane przy użyciu grzybów pleśniowych, drożdży i bakterii mlekowych. Jednak, z wyjątkiem produkcji alkoholu, dopiero od około sześćdziesięciu lat mikroorganizmy są stosowane na skalę przemysłową. W czasie pierwszej wojny światowej odpowiednio kierowaną fermentację drożdży wykorzystywano do produkcji glicerolu. Za pomocą bakterii mlekowych i grzyba Aspergillus niger uzyskuje się odpowiednio, kwas mlekowy i kwas cytrynowy, znajdujące zastosowanie w przemyśle spożywczym. Z tanich odpadków zawierających węglowodany można uzyskać aceton, butanol, 2-propanol, butanediol i inne podstawowe związki chemiczne w procesach fermentacji przeprowadzanych przez bakterie z rodzaju Clostridium i Bacillus.
Wytwarzanie antybiotyków. Odkrycie antybiotyków zapoczątkowało nowy okres w terapii medycznej i przemyśle farmaceutycznym. Penicylina i inne antybiotyki wytwarzane przez grzyby, promieniowce i inne bakterie
